随着全球贸易发展不断升级，贸易便利化的要求，尤其是贸易时间的缩短，与当前口岸通关流程间的矛盾日益凸显。目前，我国正处于全面深化改革的关键时期，各部门已出台或实施了相关政策措施。为此，我们从口岸改革目标、口岸治理结构及口岸规划布局三个方面提出改善我国口岸通关协同绩效的对策建议，进一步聚焦于进口海关作业前时间、出口海关作业后时间的压缩以及报关单占比增加，提升口岸效率，最终实现人、货物以及运输工具的合法、顺利通关。
第一，进一步明确口岸管理改革的长期目标。随着我国融入全球经济，双边及多边贸易协定的不断达成，如入世承诺中关税壁垒正稳步下降，今后口岸部门将逐步从财政性任务转为非财政性任务，尤其是从国家公共安全、经济安全的战略高度，考虑边境执法的统一和高效问题。可以考虑把口岸各管理部门的职能进行整合，实行“一口对外”。可以借鉴发达国家的做法，将海关、边检、海事在口岸的管理职能进行合并，组建集人员、货物进出和口岸事务管理于一体的单位，将有利于加强对口岸事务的统筹和控制，彻底改变原先分属不同地区、不同部门间的“政策互相打架”“责任相互交叉”等管理弊端。
第二，推进口岸治理结构改革，优化口岸协同管理机制。一方面健全口岸协同管理机构，在地方政府设立独立的口岸协同管理部门，为口岸协同管理的有效运行、协调所管辖区域的口岸管理事务提供坚实的基础；另一方面完善国际贸易“单一窗口”建设，尤其是协同绩效相对落后的地区，“单一窗口”是实现口岸管理部门信息互换、监管互认、执法互助的关键，长远来看，也是实现口岸管理“一口对外”的前提。
第三，科学设置口岸布局，提升口岸服务能力。对于通关协同绩效较好的区域，进一步推进主枢纽港口、区域性枢纽港口和内河港口在经营运作上的衔接；对于通关协同绩效较差的区域，可以考虑口岸的动态管理，对布局不合理、功能减退的给予适时优化整合。与此同时，进一步营造口岸内各项服务的良性竞争，通过市场机制等手段逐步增强口岸通关服务水平。
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