向海关申请增值税退税的正确姿势

某跨国公司中国公司经过行政复议后，海关作出行政复议决定，调低了公司应当缴纳的税款。当公司满心欢喜地拿着行政复议决定申请退税时，却发现夹在了海关与税务机关之间。原因是：该跨国公司中国公司的纳税情况比较独特，长期持有大量的进项税发票，在认证通过后分期抵扣。因此，在申请退税时，该公司不确定行政复议争议的海关缴款书项下的增值税发票是否已经实际抵扣，因而不清楚是否符合申请退税的条件。在心怀疑惑的情况下，公司忐忑地向海关提出了退税申请。海关认为，《中华人民共和国海关进出口货物征税管理办法》（以下简称《征税管理办法》）第六十七条第一款第（二）项规定，进口环节增值税已予抵扣的，该项增值税不予退还。因此，企业必须首先拿到税务机关的未抵扣证明，以证明申请退还的增值税未抵扣。为了符合海关提出的退税条件，公司转而向税务机关提出申请，要求税务机关就海关缴款书项下增值税是否已经抵扣出具证明。但税务机关却表示，无法出具某一张海关缴款书是否已经抵扣的证明。

该公司的处境非常具有代表性。在税务行政复议前置的争议解决格局下，公司必须首先缴清关税以及海关代征的进口环节增值税以及消费税后，才有资格提起行政复议和行政诉讼；而在缴纳税款取得海关缴款书后，公司又必须在规定期限申报抵扣，否则将出现因超过抵扣期限而无法抵扣增值税的情形。因此，在纳税人经过行政复议或者行政诉讼而申请退税时，正常情况下都已经向税务机关申报抵扣。至于是否已经抵扣，则只有税务机关的税务系统中才可查询。在企业的进项税发票少于销项税发票时，进项税发票已经抵扣是不存在争议的；但在企业的进项税发票长期多于销项税发票时，则会出现申报抵扣的海关缴款书项下的增值税是否已经实际抵扣的争议。在税务机关拒绝开具相关证明时，纳税人便无可避免的夹在了海关与税务机关之间。公司究竟应当怎么做，才能拿回退税款呢？问题的解决应当分为以下几个步骤。

首先，企业应当按照《征税管理办法》的规定提交申请退税的书面材料。《征税管理办法》针对不同的退税情形，规定了相应的应当提交的材料和申请退税的期限。这些硬性的规定，公司必须遵守。但应当注意的是，未抵扣证明并非《征税管理办法》规定的申请退税时应当提交的材料，纳税人并不负有证明增值税进项税额未予抵扣的举证责任。

其次，海关应当依职权查明增值税的抵扣情况。增值税是否已经抵扣，属于海关在决定退税之前应当依职权查明的内容，海关总署与国家税务总局就此做出过明确的规定。《国家税务总局、海关总署关于实行海关进口增值税专用缴款书“先比对后抵扣”管理办法有关事项的通知》(税总发[2013]76号)第二条第二款规定，“海关需要对海关缴款书涉及的进口增值税申报抵扣情况进行核查确认的，可向纳税人主管税务机关发出《进口增值税抵扣信息委托核查函》（附件5）。主管税务机关收到委托核查函后，在30日内以《进口增值税抵扣信息核查回复函》（附件6）回复发函海关。”《海关总署关于印发<海关进口增值税专用缴款书联网核查工作操作规程>的通知》（署税发[2016]186号）第十二条也规定，“现场海关在办理企业申请退税时，需要税务机关协助核查进口增值税是否已抵扣的，现场海关经办关员应在海关综合业务管理平台制发《进口增值税抵扣信息委托核查函》(格式见附件3)，并填写被核查纳税人识别号、海关缴款书号码、缴款单位名称、填发日期、税款额、联系人及联系方式等内容，经现场海关科领导审核同意后发送税务机关。”

依据上述法律规定，海关与税务机关在查明增值税抵扣情况中的联动工作机制已经确立。海关在接到退税申请后，如果对是否已经抵扣存在疑虑，应当直接向申请人的主管税务机关发函核实，而不应当再要求企业向税务机关申请开具证明。

最后，在增值税已经抵扣的情况下，申请人应当首先做进项税额转出，然后再提出退税申请。但应当注意的是，申请人在作出进项税额转出之前，必须向主管税务机关提出申请，说明是出于向海关申请退税的目的，并向主管税务机关提供相应的已申请海关退税的证明材料。纳税人切不可在未向主管税务机关作出说明的情况下，擅自转出进项税额。否则，转出进项税额有可能被主管税务机关认定无效，从而受到税务机关的处罚或者处理，同时，企业也将无法满足向海关申请退税的条件。

对于进出口企业来说，兼顾海关与税务合规具有重要的意义。企业应当充分关注海关总署与国家税务总局的联合发文，按照联合发文的要求和步骤，审慎地处理涉税事项。