随着国资国企的深化改革、现代企业制度的改造，国有资本投资、运营公司运行与治理取得了较大进步。但国有资本投资、运营公司运行和治理机制仍存在很多缺陷，严重制约了国资投资、运营公司的经营与发展。
国有资本投资、运营公司运行与治理的突出问题
1、政府行政干预多，董事会决策效率不高
根据《中华人民共和国公司法》规定，国有公司不设置股东会，而由董事会来行使相应职权。实际上，董事会就是国有资本投资、运营公司决策的最高权力机构。
在实际操作过程中，一些地方国资监管部门代表政府授权或放权不到位，对很多事项进行了过多干预，甚至代替董事会决策，导致国有资本投资、运营公司董事会决策的独立性受到很大约束，董事会独立经营决策的效率降低，发挥作用的能力受限。
此外，国有资本投资、运营公司董事会的身份与地位比较特殊，董事会成员大多不是国有资产真正的占有者，除了具有董事会成员身份外，还是公务员，因此参与决策的热情不高，并不关心企业利益，所以决策效率低下。
2、国资委监管模式有待完善
一些地方国资监管部门对国有资本投资、运营公司的运营决策干预过多、监管力度不够，监管机制不合理，缺乏对经营高管的激励约束，对内部人员的控制较弱。这些问题严重制约了国有资本投资，运营公司的规范运行。
3、缺乏有效的经理人制度及激励约束机制
一些地方国有资本投资、运营公司试点企业，经理人薪酬与业绩不成比例，缺乏有效的激励约束机制，导致经理人工作动力不足。
由此可见，国有资本投资、运营公司作为市场化的国有资本运营主体，公司治理对公司运营发展起着极为重要的作用。良好、合理的公司治理是企业运营发展的基础和必要条件，如果公司治理存在缺陷，那么国有资本投资、运营公司的运营就会变得很困难。
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