税务机关在应对中等风险案件中发现，自然人A将其持有的某全国中小企业股份转让系统（俗称“新三板”）挂牌企业的股权转让给企业B，并取得股权转让收益，但企业B却没有代扣代缴“财产转让所得”个人所得税。为此，税务机关责令企业B对自然人A股权转让所得履行代扣代缴义务。
税法分析：《国务院关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》（国发〔2013〕49号）第六条规定，市场建设中涉及税收政策的，原则上比照上市公司投资者的税收政策处理。《财政部国家税务总局 证监会关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的通知》（财税〔2009〕167号）第八条规定，对个人在上海证券交易所、深圳证券交易所转让从上市公司公开发行和转让市场取得的上市公司股票所得，继续免征个人所得税。所以部分纳税人误以为个人转让“新三板”股权可以比照个人转让上市公司股票，取得的所得免征个人所得税。
但是经过分析可以发现：
1．国发〔2013〕49号文件表述的是“原则上比照”，不具有法律约束力，不应当作为税务执法的依据，应有具体的财税文件支撑。
2．我国目前的个人所得税法规中，如果对于“新三板”的政策和上市公司一样，会单独发文或者在文件里明确规定，比如《财政部 国家税务总局证监会关于上市公司股息红利差别化个人所得税政策有关问题的通知》（财税〔2015〕101号）第四条规定，全国中小企业股份转让系统挂牌公司股息红利差别化个人所得税政策，按照本通知规定执行；《财政部国家税务总局关于完善股权激励和技术入股有关所得税政策的通知》（财税〔2016〕101号）第四条规定，全国中小企业股份转让系统挂牌公司按照本通知第一条规定执行。
所以说，依照现有的文件支撑，转让“新三板”的股票不能随意参考上市公司的个人所得税政策，自然人A股权转让所得应缴纳个人所得税，企业B应依法履行代扣代缴义务。
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