严格来说，果树烂根实际上是一类病征，而根腐病只是诱因之一，其他如农事操作伤根、环境因素胁迫、根部病害等都可造成根系损伤，最终引起果树烂根，下面我们来分别说明。
一、根部病害
果树的根部病害主要包括根腐病、白绢病、根朽病、脚腐病、紫纹羽病、白纹羽病、线虫病等。
虽然它们在发病位置及症状上略有差异，但均会引起果树烂根，地上部分势弱、黄叶、落叶等。
由致病真菌所引起的根部病害，一般在发病后，需刮除病部，而后配合甲霜噁霉灵、络氨铜、氯溴异氰尿酸、噁霉灵·福美双等药剂涂抹。
线虫病，需要施用阿维菌素、噻唑膦、淡拟紫青霉、氟吡菌酰胺、厚孢轮枝菌等杀线剂。
遵循“先治病、后养根”的原则，在进行药剂处理后可淋施海精灵生物刺激剂，帮助根系复壮。
二、环境因素
环境因素，或者称为环境胁迫，大致可分为两种类型。
其一是恶劣的气候条件造成的短时、但伤害性强的胁迫，如高温干旱、水涝、冻害等，会造成根系受损；
其二是根系长期处于不适宜的生长条件下，也就是土壤问题比较严重的果园，如pH值失调、板结、粘重等等。
前者需要提前预防，来减轻或规避掉异常天气情况对根系(果树)带来的不利影响，如雨季加强排水，高温干旱时注意淋水降温，低温来临前培土、熏烟、喷磷钾源库等等。
至于土壤问题，只是需要长期调理的，如增施有机肥、菌肥，生态栽培，合理施用化肥、生长期淋施海精灵等等。
三、农事操作伤根
比较常见的情况是肥害伤根，也有断根过猛、或者环割不当引起根饥饿的。
在补救时应根据实际情况，地上部叶面追肥如磷钾源库+芸苔素内酯，来维持树势，提升营养水平，回补根系；地下部待树势恢复后再通过淋施海精灵生物刺激剂修复受损根系，对于肥害的还应通过灌水稀释、换土等减轻肥害，有条件的果农，可以使用活土君来调节土壤，修复根系。
此外，部分地下害虫如蛴螬、叶甲、根介壳虫等也会迫害根系，要注意防控，给根系以良好的生存环境。
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