1、发票认证：进口增值税专用缴款书以及通行费增值税电子普通发票需要通过认证抵扣，农产品收购发票、农产品销售发票、道路、桥、闸通行费发票要通过申报计算抵扣来实现。用于不得抵扣项目的，认证之后不得抵扣，需要做进项税额转出。需要通过计算抵扣的扣税凭证不需要认证，直接计算抵扣。
一般纳税人开具的农产品销售发票，是指农业生产企业中的一般纳税人开具的免税农产品销售发票；小规模纳税人开具的农产品销售发票，是指小规模纳税人销售农产品依照3%征收率按简易办法计算缴纳增值税而自行开具或委托税务机关代开的普通发票；依法不需要办理税务登记的企事业单位和个人，偶然发生增值税应税行为，凭自产自销证明由销售方所在地主管国税机关代开增值税普通发票或通用机打发票。注意：批发、零售纳税人享受免税政策后开具的普通发票不得作为计算抵扣进项税额的凭证。
2、企业所得税：科技型中小企业开展研发活动中实际发生的研发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按规定据实扣除的基础上，在2017年1月1日至2019年12月31日期间，再按照实际发生额的75%在税前加计扣除;形成无形资产的，在上述期间按照无形资产成本的175%在税前摊销；
企业取得财产（包括各类资产、股权、债权等）转让收入、债务重组收入、接受捐赠收入、无法偿付的应付款收入等，不论是以货币形式、还是非货币形式体现，除另有规定外，均应一次性计入确认收入的年度计算缴纳企业所得税。
3、增值税纳税申报：增值税纳税申报比对管理操作规程是进一步加强和规范增值税纳税申报比对管理，对申报比对不符的，网上申报系统有提示信息推送，包括比对不符结果保存内容、监控级别、比对类型、比对名称、比对内容等。增值税纳税申报前，抄税-纳税申报-清卡是有先后顺序的，必须先抄税、再申报，如果比对成功，系统会自动清卡；如果比对不成功，金税盘将被锁死，需要携带金税盘到主管税务机关办税服务厅进行处理。
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